1、接通仪器电源，打开仪器开关，使仪器预热数分钟。打开电脑开关，打开Opticon Monitor软件

2、在0.2ml薄壁管或96孔不透明酶标板中加入样品，把管子放入仪器中，关上盖子，准备进行试验

3、打开软件，出现主文件（Master File）窗口，在主文件面板上的plate setup中选择New创建新的板设置，选择相应的空白，定量标准，样品，阴性对照孔及重复数，选择与实验对应的染料类型，完成对平板文件参数的输入后，按Save键保存为.plate文件

4、创建流程文件，在Protocol Setup中点击New按钮创建新的流程文件，选择反应体系、温度和热盖控制模式，点击Temperature，Maintain，Gradient，Goto，Insert，Melting Curve等按钮，分别输入温度，保持时间，梯度步骤，循环步骤，插入的步骤，融解曲线等参数设置，完成后按Save键保存为.prot文件

5、保存主文件，点击主文件的Save按钮或从File菜单选Save来保存主文件为.mast文件

6、运行程序文件，点击工具栏的Run按钮，点击Save以.tad为扩展名保存数据文件

7、使用Opticon Monitor软件可以对实验结果进行数据分析及数据输出

8、实验结束后关闭软件，PCR仪电源，关闭电脑，填写仪器使用记录日志。