1、确认系统数据线和电源线连接正常后，打开 CFX96 电源开关，系统进入自检；

2、自检完成后启动 CFX96 Manager，PCR仪器屏幕显示红色“Under remote control”；

3、点击“Experiment setup”弹出实验设置选项，在Protocol标签下， “Create New”新建热循环程序；

4、确定热循环程序后点击“Next”或“Plate”标签进入样品位置及类型设定，从Scan Mode里选择荧光扫描模式，点击Select Fluorophores选择荧光素，在Sample Type下拉菜单指定样品类型，Replicate设置样品重复数，Concentration设置标品浓度，编辑好板位文件后，点OK保存；

5、确定样品设置后点击“Next”或者Start Run准备运行系统，点击Open Lid打开样品槽并放置样品，点击Close Lid关闭样品槽（不得强行掰开或压合），热盖闭合后点击Start Run确定后开始运行；

7、程序运行时可对PCR程序循环数、样品类型再编辑，也可编辑新的实验方案或者分析数据；